在水生态城市建设方面，该区强化污水处理厂及管网建设和管理。区政府专门成立“网建办”，连续两年投入约2亿元，建设城区污水截留工程233处，新增管网20余公里，城区污水处理量提升至5.2万吨/日以上，污水收集率达到86%以上。大力推进工业园区污水处理厂建设，目前已基本建成银翔园区、草街园区、农创园、工业园核心区等4座工业园区污水处理厂。
该区还投入2.8亿元，推进镇街污水处理设施建设，目前已建成22个场镇污水处理厂。2015年，合川在全市率先与重庆环投公司签订了《乡镇污水处理厂建设运营协议》，进一步强化了镇街污水处理设施的运维管理。
同时，该区充分发挥部门合力、争取上级支持，推进生态文明建设。例如水务部门和环保部门积极合作，争取到国家和市级的补助资金，推进辖区南溪河、小安溪等次级河流的整治，有力地推进了该区生态文明建设。